Gümrükte sonradan kontrol denetimi, firmaların ithalat süreçlerini geriye dönük inceleyen riskli bir süreçtir. Gümrük sonradan kontrol rehberi ilkelerine uymayan firmalar, kıymet ve GTİP hataları nedeniyle gümrük denetiminde geriye dönük cezalar ile karşılaşabilir. Gümrük müfettişi denetimi öncesi proaktif iç denetim, riskleri azaltmanın en etkin yoludur.